1599 baute Hans Schwarzenbach in der Pfarrkirche St. Pauls eine Schwalbennestorgel; bereits 1609 wurde diese auf die neu errichtete Westempore versetzt. Es folgten Reparaturen von Lucio Valvassori (1618); Daniel Herz (1670) und Sebastian Achamer (1674)

1688/89 baute Eugenio Casparini in St. Pauls eine neue Orgel. Die Schwarzenbach-Orgel nahm er in Zahlung und verkaufte sie um 350 Gulden nach Auer weiter, wo sie 1690 in der Pfarrkirche St. Peter ihren endgültigen Platz fand. im 18./19. Jh. erfolgten u.a. Reparaturen von Andreas Mauracher und Josef Sies (1870)

1982-86 wurde die Orgel von Johann Pirchner - Steinach a. Br., Tirol (A) - auf ihre ursprüngliche Disposition zurückrestauriert. Für die Rekonstruktion des Regal 8' wurden die Mensurenwerte des Innsbrucker Ebert-Orgel-Regals verwendet. Die Stellung der Spielanlage - ursprünglich an der Hinterseite des Prospektes - blieb dabei vorne.

Von der Orgel Schwarzenbachs sind noch das Gehäuse mit den Flügeltüren, die Manualwindlade, und ca. 30% des Pfeifenbestandes (Principal 8', Octav 4' und Superoctav 2') erhalten.

Das Instrument ist die älteste erhaltene Kirchenorgel Südtirols.